Au XIXe siècle, le comte Henry de La Vaulx part en Patagonie sur les traces de géants mythiques. Au nom de la Science, il se spécialise dans le pillage de tombes mapuches dont il ramène le contenu au Musée de l'Homme. Les descendants réclament aujourd'hui les restes à la France. Gigantes nous plonge au cœur de la culture mapuche, sur fond de lutte pour le territoire usurpé et questionne la suprématie auto-proclamée des pays colonisateurs.